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外泌體RNA測序

產品介紹

Exosomes作為活細胞分泌的含有RNA和蛋白質的微囊,廣泛分布於外周血、尿液、唾液、腹水、羊水等多種體液中。體液中exosomal RNA(特別是miRNA等非編碼RNA)在不同的疾病模型中存在明顯的表達差異。通過高通量技術對外泌體RNA進行測序,可快速高效獲得外泌體RNA的全麵信息,是疾病診斷和隨訪的理想手段。

產品特點

YOPLAY生物提供外泌體提取試劑盒,能夠快速分離提取exosome RNA進行建庫測序,滿足外泌體mRNAlncRNAcircRNAmiRNA的不同研究需求。

1. Long RNA

由於很多基因位點會生成轉錄方向相反的、具有重要調控功能的反義RNA。常規的建庫方法無法區分這些反義RNAYOPLAY采用鏈特異性的建庫方法,可以準確檢測反義RNA,從而提供更全麵的轉錄組信息

2. Small RNA

在建庫技術方麵采用QIAseq NGS panels專有的數字NGS技術,基於QIAseq miRNA Library Kit的建庫策略無需切膠分離小RNAGel-free),能夠實現對外泌體miRNA等稀少樣本的無偏向準確定量。結合最新的高通量測序技術和生物信息分析方案將為您提供最為全麵的外泌體miRNA測序服務

操作說明

1、樣本量

樣本類型

Long RNA

Small RNA

血清、血漿

4ml

4ml

細胞培養上清、尿液等體液

50ml

50ml

外泌體

400μl

400μl

Total RNA

500ng

2ng,體積不小於20μl


2樣本運輸與保存

樣本-80℃低溫保存,樣品保存期間避免反複凍融;樣本裝於RNase-free離心管中,封口膜封好後,幹冰運輸。樣品郵寄提前跟公司聯係並告知快遞單號。樣本寄送必須隨附送樣單,送樣單盡量填寫完整、清晰,仔細核對確保填寫信息與樣本信息完全一致,並將填好的送樣單發送到公司郵箱info@us-yslshoes.com

相關產品信息

1、測序方案

內容

Long RNA

Small RNA

測序模式

PE150

SE50

測序數據量

6-10Gb clean data

10Mb clean reads

測序平台

Illumina Hiseq3000/4000

Illumina Hiseq3000/4000

2、數據分析

mRNA

LncRNA

CircRNA

miRNA

mRNA識別和注釋

mRNA表達譜

差異mRNA篩選

差異mRNA聚類

差異mRNA GO分析

差異mRNA KEGG通路分析

LncRNA識別和注釋

LncRNA表達譜

差異LncRNA篩選

差異LncRNA聚類

LncRNA靶基因分析

LncRNA靶基因GO分析

LncRNA靶基因KEGG通路分析

circRNA識別與注釋

circRNA標準化

circRNA表達譜

差異表達circRNA篩選

差異表達circRNA的靶基因分析

差異circRNA靶基因的GO分析

差異circRNA靶基因的KEGG分析

circRNA-miRNA相互作用預測

circRNA-miRNA網絡

circRNA可視化

small RNA鑒定和注釋

已知microRNA鑒定

新的microRNA預測

家族分析、結構分析

差異表達分析

差異表達miRNA靶基因分析

差異表達miRNA靶基因功能注釋和富集分析

3、實驗室收到樣本後60個工作日完成檢測及數據分析(單次送樣量大於10個可能會出現延遲)。如果客戶需要高級數據分析,費用根據分析內容另行收取。


產品數據

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